Plates-Formes
Spectrométrie de masse
Présentation
Récemment mis en place à l’IBPC grâce à des financements LABEX et EQUIPEX, le Plateau Protéomique de l’IBPC met ses équipements et son savoir-faire au service de la communauté scientifique.
Les objectifs du plateau sont :
- Conseiller les chercheurs sur les techniques disponibles sur le plateau après avoir définis avec eux leurs besoins en analyses
- Réaliser les analyses de la préparation des échantillons à l’exploitation des résultats
- Développer de nouvelles techniques d’analyses en fonction des besoins des chercheurs telle que la quantification de type label-free
- Former les chercheurs aux techniques de préparation d’échantillons, d’analyses et d’exploitation de résultats
Le plateau propose des prestations de type collaborative ou de service afin de répondre au mieux aux besoins des chercheurs.
Pour nous contacter : proteomics@ibpc.fr
Equipements
La plateforme de spectrométrie de masse de l'IBPC est dotée :
- d'un spectromètre de masse en tandem neuf à très haute résolution Q Exactive (Thermoscientific) couplé en amont à une nano-chromatographie liquide à ultra haute performance Nano Easy1000 (Thermoscientific)
- d'un spectromètre de masse MALDI-TOF/TOF Axima Performance (Shimadzu)
- d'un sysystème HPLC permettant une chromatographie préparative et analytique
Analyses
La plateforme propose différents types d’analyses :
- Digestion gel d’électrophorèse (spot ou bande)
- Digestion en solution
- Purification de peptides C18
Des protocoles sont disponibles ci-dessous mais une prise de contact avec le plateau est recommandée avant toute préparation d’échantillon
Pour toute demande d’analyse contacter : proteomics@ibpc.fr
Réservation
Un planning de réservation du MALDI-TOF est désormais disponible en ligne pour le personnel formé de l’IBPC. Pensez à réserver.
https://resa-equipement.ibpc.fr/
Pour toute demande de réservation externe à l’IBPC, ou pour toute demande de formation contacter hamon@ibpc.fr
Publications
2018
Zhan Y, Marchand CH, Maes A, Mauries A, Sun Y, Dhaliwal JS, Uniacke J, Arragain S, Jieng H, Gold ND, Martin V J-J, Lemaire SD, Zerges W. Functions of the pyrenoid revealed by proteomics in Chlamydomonas reinhardtii. PLOS ONE.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29481573
2017
Pérez-Pérez ME, Mauriès A, Maes A, Tourasse NJ, Hamon M, Lemaire SD, Marchand CH. The Deep Thioredoxome in Chlamydomonas reinhardtii: New Insights into Redox Regulation (2017). Molecular Plant 10(8):1107-1125.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28739495
2016
Berger H, De Mia M, Morisse S, Marchand CH, Lemaire SD, Wobbe L, Kruse O. A Light Switch Based on Protein S-Nitrosylation Fine-Tunes Photosynthetic Light Harvesting in Chlamydomonas. Plant Physiology 171(2):821-32.
Comité de pilotage
Responsable Scientifique :
Responsable Technique :
Ingénieur fonctionnement plateau:
email : hamon@ibpc.fr
