Plates-Formes

Plateforme de Génomique Fonctionnelle

Présentation

Récemment mise en place à l’IBPC, la plateforme de génomique fonctionnelle met son savoir-faire au service des unités de l’IBPC et collabore avec la communauté scientifique.

La plateforme de génomique fonctionnelle est également équipée de plusieurs appareils pour le traitement et l'analyse des gels, notamment un Typhoon FLA9500 (GE), 2 Gel Docs (Biorad) et un révélateur pour autoradiogrammes (Curix), ainsi qu'un compteur à scintillation (Hidex) pour le traitement des échantillons radioactifs.

Pour nous contacter : bioinfo@ibpc.fr

Les objectifs de la plateforme :

  • Conseiller et former les chercheurs de l'IBPC pour les analyses bioinormatiques courantes
  • Développer de nouveaux outils d'analyse et de visualisation adaptés aux dernières technologies et aux utilisateurs.
  • Développer des projets de recherche collaboratifs avec les différentes équipes et unités de recherche de l’IBPC.
  • Réunir les bio-informaticiens de l’institut et mettre en commun les nombreuses compétences et ressources en analyse de données biologiques.

Spécificités thématiques et expertises

  • Analyses NGS (génomique et transcriptomique), protéomique et protéomique quantitative.
  • Séquençage, assemblage et annotation de génomes bactériens et eucaryotes.
  • Métagénomique et annotation fonctionnelle.
  • Biologie évolutive.
  • Visualisation et exploration supervisée de larges collections de données biologiques.

contact :

Responsable scientifique :

  • Alexandre MAES (IR UMR 8226)

Mail : alexandre.maes@ibpc.fr


Ingénieur plateforme :

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