Chez les Viridiplantae (plantes terrestres et algues vertes), la régulation de l’expression des gènes chloroplastiques agit presque exclusivement au niveau post-transcriptionnel, mais les mécanismes de la régulation restent inconnus chez les eucaryotes photosynthétiques importants des océans, tels que les diatomées, qui ont acquis leur plastide à partir d’une algue rouge par endosymbiose secondaire et tertiaire. Nous utilisons des approches transcriptomiques et protéomiques pour élucider les niveaux de régulation (transcriptionnelle ou post-transcriptionnelle) en jeu chez les diatomées (voir également le thème 3). Afin de mieux comprendre la nature du contrôle nucléaire de l’expression des gènes plastidiques chez les diatomées, nous combinons ces approches fonctionnelles à des approches de génomique comparative et d’apprentissage automatique pour comprendre comment les innovations génétiques acquièrent de nouvelles fonctions à l’échelle des temps évolutifs. Nous explorons également l’origine évolutive du processus CES, un processus de régulation traductionnelle dans les organites découvert dans notre laboratoire, qui est probablement apparu à la suite de l’endosymbiose primaire avec une cyanobactérie (voir également le thème 1).
