La liste ci-dessous est une liste non exhaustive (n’hésitez pas à nous contacter pour ajouter votre laboratoire) des laboratoires spécialistes de la bioénergétique en France:
UMR7283, LCB Equipe Microbial Respiration (Laboratoire de Chimie Bactérienne, Aix-Marseille Université-CNRS). Thématique : Etude intégrée des complexes bioénergétiques procaryotes : de la molécule à la cellule. Étude du fonctionnement, de l’organisation spatiale et de la diversité de complexes bioénergétiques. Espèces modèles : Escherichia coli, Bacillus subtilis, Lactococcus cremoris, Lactiplantibacillus plantarum. Savoir-faire: manipulation génétique d’E. coli, B subtilis et de bactéries lactiques, biochimie des protéines membranaires, analyses bioinformatiques, enzymologie, biophysique des protéines, biologie cellulaire, microscopie à fluorescence, etc…
UMR7141, P3M (Laboratoire de Photobiologie et Physiologie des Plastes et des Micro-algues, Institut de Biologie Physico-Chimique, CNRS/Sorbonne université). Espèces modèles de micro-algues: Chlamydomonas reinhardtii, Phaeodactylum tricornutum, Cyclotella cryptica. Savoir-faire: génétique des micro-algues, biochimie des protéines membranaires, biophysique de la photosynthèse (fluorométrie, spectroscopie de différence d’absorption).
UMR5095, BioDynaMit (IBGC, CNRS Bordeaux). Le laboratoire s’intéresse aux déficiences bioénergétiques mitochondriales secondaires à des stress métaboliques ou mutations pathogènes responsables de maladies mitochondriales. Espèces modèles: modèles murins transgéniques, lignées cellulaires transgéniques (fibroblastes embryonnaires, lignées humaines). Savoir-faire: caractérisation du métabolisme énergétique cellulaire et mitochondriale (Oxygraphie haute résolution, mesures des potentiel redox (NAD(P)H/NAD(P)+) et phosphates (ATP/ADP.Pi), mesure de la production de ROS, potentiel de membrane, électrophorèses natives/dénaturantes, mesure de la dynamique mitochondriale (morphologie, distribution et mobilité)
UMR5525, TIMC équipe TrEE (Translational microbiology Evolution – Engineering, CNRS, Université Grenoble Alpes). Thématique : Biosynthèse et évolution des quinones isoprénoïdes et de leurs interactions. Espèces modèles : Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Pseudomonas aeruginosa, microorganismes. Savoir-faire: quantification et caractérisation de quinones isoprénoïdes (HPLC-détection électrochimique – spectrométrie de masse), génétique d’E. coli et de S. cerevisiae, biochimie des protéines, analyses phylogénétiques, bioinformatique.
UMR7265, BIAM Equipe Photosynthèse & Environnement, P&E (CEA/CNRS/Aix-Marseille Université). Notre équipe étudie les facteurs moléculaires qui régulent le rendement de la photosynthèse et son adaptation à l’environnement. Organismes d’étude : plantes, micro-algues vertes, cyanobactéries. Savoir-faire: manipulation génétique de micro-algues et cyanobactéries, biochimie des protéines, biophysique de la photosynthèse (fluorométrie, spectroscopie de différence d’absorption, échange de gaz).
UMR8226 Equipe Dynamique Membranaire et Modifications Post-Traductionnelles (IBPC, CNRS, Sorbonne Université). Thématique : Dynamique mitochondriale (Fusion et fission), Mitophagie, Contact entre organelles, Système Ubiquitine-Protéasome. Espèce modèle : Saccharomyces cerevisiae Savoir-faire: Microscopie à fluorescence, Spectrométrie de masse, génétique de S. cerevisiae, biochimie des protéines, biologie cellulaire du réseau mitochondriale et de son association avec le Reticulum Endoplasmique, les peroxisomes, etc…
UMR7281, BIP (Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, Aix-Marseille Université, CNRS); Thématique : Etude intégrée de la bioénergétique des microorganismes: de la molécule aux consortia, diversité et évolution. Espèces modèles : entre autres, Halorhodospira halophila, Aquifex aeolicus, Shewanella oneidensis et sp. ANA-3, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Solidesulfovibrio fructosivorans, Thalassiosira pseudonana, Chlamydomonas reinhardtii. Savoir-faire: génétique d’E. coli, Shewanella, Pseudomonas aeruginosa, Solidesulfovibrio fructosivorans, Chlamydomonas reinhardtii, biochimie des protéines, analyses phylogénétiques, bioinformatique, biophysique des protéines, biologie cellulaire.
UMR5248-CNRS-INP, Bordeaux, CBMN (Chimie et Biologie des Membranes et des Nanoobjets). Le CBMN compte environ 200 personnes réparties en 16 groupes et 4 pôles. L’objectif du CBMN est la compréhension des assemblages chimiques et biologiques et l’étude de leurs propriétés. Dans le pôle “Biomedical research, Fundamental and translational”, le groupe “Architecture des complexes membranaires” s’intéresse à l’assemblage de diverses pompes à efflux d’E.coli et de Pseudomonas aeruginosa. Savoir-faire: reconstitution de complexes membranaires en détergents et nanodisques, microscopie électronique et cryo-microscopie électronique.
UMR7099, Laboratoire BPM (Biochimie des Protéines Membranaires). Thématique : Etude des mécanismes fondamentaux de la fonction des protéines membranaires et de la dynamique des membranes. Espèces modèles : Chlamydomonas reinhardtii, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens. Savoir-faire: génétique et physiologie microbienne, approches biochimiques et biophysiques de pointe (cryo-EM, RMN, fluorescence, spectroscopies) et développements méthodologiques (amphipols, hôtes bactériens optimisés, outils pour la cryo-EM, reconstitution dans des environnements membranaires mimétiques)
UMR7140 LBS Equipe Chimie de la Matière Complexe (Laboratoire de Bioélectrochimie et Spectroscopie, Université de Strasbourg). Thématique: Etude du mécanisme réactionnel des enzymes de la chaine respiratoire par des méthodes couplées électrochimie/spectroscopie. Espèces modèles: Escherichia coli, Paracoccus denitrificans, Thermus thermophilus, Mycobacterium smegmatis.Savoir-faire: modification d’électrodes et de surfaces métalliques par des protéines, électrochimie directe de protéines membranaires, spectroscopies Raman et Infrarouge exaltées de surface, plasmonique, spectroélectrochimie