La liste ci-dessous est une liste non exhaustive (n’hésitez pas à nous contacter pour ajouter votre laboratoire) des laboratoires spécialistes de la bioénergétique en France: UMR7283, IMM (Laboratoire de Chimie Bactérienne, CNRS, Université Aix-Marseille). Le laboratoire accueille 13 équipes étudiant toutes le fonctionnement des bactéries aux niveaux moléculaire, cellulaire, multicellulaire et écologique. A travers les espèces modèles bactériennes B. subtilis, E. coli ou M. magneticum,les différentes équipes explorent les mécanismes fondamentaux d’adaptation, permettant aux bactéries de détecter leur environnement et de former des consortiums multicellulaires complexes.
UMR7141, P3M (Laboratoire de Photobiologie et Physiologie des Plastes et des Micro-algues, Institut de Biologie Physico-Chimique, CNRS/Sorbonne université). Espèces modèles de micro-algues: Chlamydomonas reinhardtii, Phaeodactylum tricornutum, Cyclotella cryptica. Savoir-faire: génétique des micro-algues, biochimie des protéines membranaires, biophysique de la photosynthèse (fluorométrie, spectroscopie de différence d’absorption).
BioDynaMit (IBGC-UMR5095, CNRS Bordeaux). Le laboratoire s’intéresse aux déficiences bioénergétiques mitochondriales secondaires à des stress métaboliques ou mutations pathogènes responsables de maladies mitochondriales. Espèces modèles: modèles murins transgéniques, lignées cellulaires transgéniques (fibroblastes embryonnaires, lignées humaines). Savoir-faire: caractérisation du métabolisme énergétique cellulaire et mitochondriale (Oxygraphie haute résolution, mesures des potentiel redox (NAD(P)H/NAD(P)+) et phosphates (ATP/ADP.Pi), mesure de la production de ROS, potentiel de membrane, électrophorèses natives/dénaturantes, mesure de la dynamique mitochondriale (morphologie, distribution et mobilité)
UMR5525, TIMC équipe TrEE (Translational microbiology Evolution – Engineering). Thématique : Biosynthèse et évolution des quinones isoprénoïdes et de leurs interactions. Espèces modèles : Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Pseudomonas aeruginosa, microorganismes. Savoir-faire: quantification et caractérisation de quinones isoprénoïdes (HPLC-détection électrochimique – spectrométrie de masse), génétique d’E. coli et de S. cerevisiae, biochimie des protéines, analyses phylogénétiques, bioinformatique.
Equipe Photosynthèse & Environnement, P&E (BIAM, UMR7265, CEA/CNRS/Aix-Marseille Université). Notre équipe étudie les facteurs moléculaires qui régulent le rendement de la photosynthèse et son adaptation à l’environnement. Organismes d’étude : plantes, micro-algues vertes, cyanobactéries. Savoir-faire: manipulation génétique de micro-algues et cyanobactéries, biochimie des protéines, biophysique de la photosynthèse (fluorométrie, spectroscopie de différence d’absorption, échange de gaz).
Equipe Dynamique Membranaire et Modifications Post-Traductionnelles (IBPC-UMR8226-CNRS-Sorbonne Université). Thématique : Dynamique mitochondriale (Fusion et fission), Mitophagie, Contact entre organelles, Système Ubiquitine-Protéasome. Espèce modèle : Saccharomyces cerevisiae Savoir-faire: Microscopie à fluorescence, Spectrométrie de masse, génétique de S. cerevisiae, biochimie des protéines, biologie cellulaire du réseau mitochondriale et de son association avec le Reticulum Endoplasmique, les peroxisomes, etc…
Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, UMR7281 (Aix-Marseille Université-CNRS)https://bip.cnrs.fr/ Thématique : Etude intégrée de la bioénergétique des microorganismes: de la molécule aux consortia, diversité et évolution. Espèces modèles : entre autres, Halorhodospira halophila, Aquifex aeolicus, Shewanella oneidensis et sp. ANA-3, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Solidesulfovibrio fructosivorans, Thalassiosira pseudonana, Chlamydomonas reinhardtii. Savoir-faire: génétique d’E. coli, Shewanella, Pseudomonas aeruginosa, Solidesulfovibrio fructosivorans, Chlamydomonas reinhardtii, biochimie des protéines, analyses phylogénétiques, bioinformatique, biophysique des protéines, biologie cellulaire.
Equipe Respiration bactérienne (Laboratoire de Chimie Bactérienne, UMR7283, Aix-Marseille Université-CNRS) https://lcb.cnrs.fr/team/magalon/ Thématique : Etude intégrée des complexes bioénergétiques procaryotes : de la molécule à la cellule. Étude du fonctionnement, de l’organisation spatiale et de la diversité de complexes bioénergétiques. Espèces modèles : Escherichia coli, Bacillus subtilis, Lactococcus cremoris, Lactiplantibacillus plantarum. Savoir-faire: manipulation génétique d’E. coli, B subtilis et de bactéries lactiques, biochimie des protéines membranaires, analyses bioinformatiques, enzymologie, biophysique des protéines, biologie cellulaire, microscopie à fluorescence, etc…