UMR8261 Expression Génétique Microbienne

CNRS / Université Paris Diderot Paris 7

Directeur : Harald Putzer, Directeur-adjoint : Ciarán Condon

Séminaires d'Ici et d'

  • Année 2017 - 2018
  • 2016 - 2017
  • 2015 - 2016
  • 2014 - 2015
  • 2013 - 2014
  • 2012 - 2013
  • 2011 - 2012
  • 2010 - 2011
  • 2009-2010

 

Année 2017 - 2018

Colloque

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Jeudi 19 octobre 2017 à la Bibliothèque :

Celebrating Mathias Springer's 48-­-year career at the IBPC

« Translation, post-­-transcriptional control and sundry other topics of interest.»

Program and a short biography

A short illustrated biography

Thèses

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15 septembre 2017 : Jonathan JAGODNIK (Equipe E. Hajnsdorf : Contrôle de l'expression génétique par les ARN) « Multiples mécanismes de régulation post-transcriptionnelle chez les bactéries : des structures de l'ARN messager aux ARN régulateurs. » sous la direction de : Maude Guillier et Claude Chiaruttini

03 octobre 2017 : Anaïs BROSSE (Equipe E. Hajnsdorf : Contrôle de l'expression génétique par les ARN) « Circuits mixtes de régulation entre petits ARN régulateurs et systèmes à deux composants chez Escherichia coli. » sous la direction de : Maude Guillier

 

Séminaires

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8 décembre 2017 : Elena BIDNENKO (Micalis, INRA Jouy en Josas ) «Termination factor Rho: from the control of pervasive transcription to cell fate determination in Bacillus subtilis . » invitée par : Ciaràn Condon

17 novembre 2017 : Robert BRITTON (Baylor College of Medicine, Texas) «GTPase control of large subunit ribosome biogenesis . » invité par : Ciaràn Condon

10 novembre 2017 : Mélodie DUVAL (Institut Pasteur) «E. coli Ribosomal Protein S1 : at the crossroad between translation and regulation of gene expression. » invitée par : Maude Guillier

03 octobre 2017 : Jean-Francois COLLET (de Duve Institute, Université catholique de Louvain) «How bacteria protect their cell envelope. » invité par : Maude Guillier

29 septembre 2017 : Sigrid MILLES (IBS Grenoble) «Plasticity and dynamics of intrinsically disordered protein systems - a combined fluorescence and nuclear magnetic resonance perspective . » invitée par : Carine Tisné

15 septembre 2017 : Eric MASSE (Université de Sherbrooke) «The hidden targetome and mechanism of bacterial small RNAs. » invité par : Maude Guillier

8 septembre 2017 : Alexandre SMIRNOV (GMGM Université de Strasbourg) « RNA-binding hubs in bacterial and bacteria-derived systems. » invité par : Carine Tisné

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2016 - 2017

 

HDR

3 novembre 2016 : Maude GUILLIER (Equipe E. Hajnsdorf : Controle de l'expression génétique par les ARN) Université Paris 7 D. Diderot

Séminaires

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16 juin 2017 : Yves HENRY (Laboratoire de Biologie Moleculaire Eucaryote
Centre de Biologie Intégrative Université de  Toulouse - CNRS) «The Npa1p complex, a crucial player in the synthesis of the large ribosomal subunit in yeast. »invité par : Valérie Heurgué-Hamard et Caroline Lacoux

9 juin 2017 : Martial MARBOUTY (Institut Pasteur, Paris) « Metagenomes in three dimensions. » invité par : Grégory Boël

29 mai 2017 : Geneviève ANHOURY « Projection de “POURQUOI CHERCHEZ-VOUS ?” . » invitée par : Naïma Belgareh-Touzé et Josette Banroques

19 mai 2017 : Annick JACQ (I2BC - Université Paris Sud) « Petits ARN régulateurs chez un vibrio pathogène de l'huître, quorum sensing et adaptation métabolique. » invitée par : Maude Guillier

28 avril 2017 : Philippe DELEPELAIRE (UMR7099, IBPC) « Heme acquisition in gram-negative: the contribution of structural biology. »
invité par : Ciaràn Condon

21 avril 2017 : Valérie de CRECY-LAGARD (University of Florida, Gainesville) « Synthesis and function of universal modifications of tRNAs: focus on queuosine (Q) and threonylcarbamoyladenosine (t6A) . » invitée par : Valérie Heurgué-Hamard

24 mars 2017 : Nara FIGUEROA-BOSSI (I2BC, U. Paris Saclay)« An allosteric model for RNA sampling and matchmaking by Hfq . » invitée par : Ciaràn Condon et Mathias Springer

10 mars 2017 : Ingrid LAFONTAINE (Laboratoire de Physiologie Membranaire et Moléculaire du Chloroplaste, IBPC) « How do yeasts acquire new genes? » invitée par : Harald Putzer

3 mars 2017 : Mickael COHEN (LBMCE, IBPC) « Mitochondrial dynamics and Mitophagy. » invité par : Ciaràn Condon

24 février 2017 : Frédéric BOCCARD ( I2BC Univ. Paris Saclay) « Control of chromosome conformation and segregation in bacteria : strategies and mechanisms. » invité par : Ciaràn Condon et Mathias Springer

13 janvier 2017 : Giulia OLIVA (Institut Pasteur) « Regulatory circuit involved in Legionella pneumophila virulence: the role of Hfq and the cis-encoded sRNA anti-hfq. » invitée par : Ciaràn Condon

09 décembre 2016 : Marianne DEPAEPE (Institut Pasteur) «Coût et bénéfice du prophage lambda dans le tube digestif de souris. » invitée par : Fanette Fontaine

25 novembre 2016 : Philippe GLASER (Institut Pasteur) « Evolutionary genomics of antibiotic resistance . » invité par : Ciaràn Condon

18 novembre 2016 : Pascale COSSART (Institut Pasteur) « N-terminomics and the discovery of a membrane mini-protein critical for the stress response in bacteria.» invitée par : Ciaràn Condon

16 novembre 2016 : Max GOTTESMAN (Columbia University NY) «Coupling and Uncoupling Transcription and Translation» invité par : Ciaràn Condon

25 octobre 2016 : Stéphanie OERUM (University of Oxford) « A link between mitochondrial tRNA modification and a rare metabolic disease.»
invitée par : Carine Tisné

21 octobre 2016 : Selvasankar MURUGESAN (Departamento de Genética y Biología Molecular, Cinvestav, Mexico) « Study of the colon microbiota associated to obesity in Mexican children.» invité par : Soumaya Laalami et Phillipe Regnier

10 octobre 2016 : Usha VIJAYARAGHAVAN (Indian Institute of Science, Bangalore, India) « Functions and global dependencies of fission yeast splicing factors suggest diversity in spliceosome assembly and splice-site choice» invitée par : Kyle Tanner

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Année 2015 - 2016

 

Thèses

Jeudi 31 mars 2016 : Anna LIPONSKA (Equipe H. Putzer) « RNase J of Chlamydomonas reinhardtii. » sous la direction de Harald Putzer

Séminaires

1 juin 2016 : Emanuele BIONDI (LCB CNRS- Université Aix-Marseille) «The complexity of CtrA phosphorylation during cell cycle progression in Caulobacter crescentus.» invité par : Maude Guillier

27 mai 2016 : Olivier BENSAUDE (IBENS ENS, Paris) «Mechanism of positive transcription elongation factor (P-TEFb) regulation by the 7SK snRNA .» invité par : Kyle et Josette Tanner

17 mai 2016 : Rick GOURSE (University of Wisconsin, USA) «Old Questions, New Answers: The Bacterial Stringent Response.» invité par : Ciaràn Condon

13 mai 2016 : Sergine EVEN (INRA, STLO, Rennes) «Approches microbiennes de lutte contre Staphylococcus  aureus. » invitée par : Harald Putzer

08 avril 2016 : Benjamin EZRATY (LCB, Marseille) «Enzyme de réparation des protéines oxydées: un nouveau système de contrôle qualité dans le périplasme.» invité par : Maude Guillier

1 avril 2016 : Vincent ANQUETIL (Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière, Paris) «High throughput genetic study of splicing. » invité par :Gregory Boël

25 mars 2016 : Xavier CHARPENTIER (Centre International de Recherche en Infectiologie, Inserm U1111, Lyon) «Silencing of natural transformation by an RNA chaperone and a multi-target small RNA. » invité par : Maude Guillier

18 mars 2016 : Gilles Van WESSEL (Molecular Biotechnology Sylvius laboratories, Leiden University,The Netherlands) «The Google maps of amino sugar metabolism and discovery of a new sugar isomerase in Streptomyces. » invité par : Jackie Plumbridge

19 février 2016 : Dominique SCHNEIDER (Université de Grenoble) «Tempo and mode of genome and network evolution during a long-term experiment with bacteria. » invité par : Jackie Plumbridge

05 février 2016 : Olivier DUSSURGET (Institut Pasteur, Paris) « Host defense evasion by pathogens : Listeria’s secret weapon revealed .»
invité par : Fanette Fontaine

29 janvier 2016 : Saurabh RAJ (Laboratoire de Vincent Croquette, Laboratoire de Physique Statistique - UMR 8550, ENS) «Single molecule study of DEXH/D-box helicases.» invité par : Kyle Tanner

22 janvier 2016 : Françoise NOREL (Macromolecular Systems and Signaling Laboratory,  Institut Pasteur) «Repressor activity of the stress sigma factor RpoS/σS: mechanisms and fitness effects .» invitée par : Ciaràn Condon

18 décembre 2015 : Daniel GAUTHERET (Université Paris-Sud, Orsay) «Detecting differential RNA processing events – why you are doing it wrong. »invité par : Eliane Hajnsdorf

11 décembre 2015 : Marina ELEZ (Laboratoire Jean Perrin, Université Pierre et Marie Curie, Paris) «Mutation rates and fitness effects measured directly on individual Escherichia coli cells .» invitée par : Fanette Fontaine

27 novembre 2015 : Gaëlle DEMARRE (Collège de France, Paris) « LF82 survival within the mature phagolysosome of macrophages» invitée par : Fanette Fontaine

25 novembre 2015 : George OWTTRIM (Department of Biological Sciences
University of Alberta, Edmonton Alberta Canada) « Holding on: Post-transcriptional regulation of gene expression by RNA clamping. » invité par : Kyle Tanner

20 novembre 2015 : Pascale LESAGE (Hôpital Saint Louis, Paris) « An RNA polymerase III subunit determines sites of Ty1 retrotransposon integration» invitée par : Ciaràn Condon

06 novembre 2015 : Kathrin BAUMGARDT (Giessen University, Allemagne) «RNase E and the small RNA RcsR1 affect the 5’ UTR
of the acyl-homoserine lactone synthase gene in Sinorhizobium meliloti.»
invitée par : Ciaràn Condon

18 septembre 2015 : Fériel SKOURI-PANET (Institut de Minéralogie et de Physique des Milieux Condensés, IMPMC, Paris) «Etude d’un exemple de biominéralisation : rôle des phosphatases alcalines  dans la formation d’hydroxyapatite par une β-protéobactérie Ramlibacter tataouinensis »
invitée par : Anaïs Brosse

07 septembre 2015 : Jeff COLLER (The Center for RNA Molecular Biology, Case Western Reserve University, USA) «The genetic code is a major determinate of mRNA fate » invité par : Ciaràn Condon

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Année 2014 - 2015

 

26 juin 2015 : Martina SAUERT (Max Perutz Laboratories Vienna) «The leaderless mRNA regulon: An important tool for the post-transcriptional stress response in Escherichia coli. » invitée par : Maude Guillier

5 juin 2015 : Romain BRIANDET (AgroParisTech Massy) «Bioacide action in multispecies biofilms» invité par : Harald Putzer

29 mai 2015 : Antonin MARCHAIS (Swiss Federal Institute of Technology Zurich, Suisse) «New bioinformatic methodologies to study A.thaliana  sRNA deep-sequencing provide insight into long dsRNA processing.» invité par : Eliane Hajnsdorf

22 mai 2015 : Jean-Marc GHIGO (Institut Pasteur) «Contribution of bacterial volatile molecules to the dynamics of biofilm communities »
invité par : Ciaràn Condon

7 mai 2015 : Christopher WEIDENMAIER (Interfaculty Institute for Microbiology  and Infection Medicine Tübingen, Allemagne) «Unraveling the regulation of cell wall glycopolymer (CWG) biosynthesis in Gram-positive bacteria allows novel insights into the role of CWG in bacterial physiology and virulence» invité par : Harald Putzer

17 avril 2015 : Francis REPOILA (INRA Jouy-en-Josas) «The Primary and Processed transcriptome in Enterococcus faecalis: from RNA molecules towards adaptation processes.» invité par : Ciaràn Condon

10 avril 2015 : Caroline GIROUD (Université de Caen) «The C-terminal region of the RNA helicase CshA is required for the interaction with the degradosome and turnover of bulk RNA in the opportunistic pathogen Staphylococcus aureus. » invitée par : Harald Putzer

3 avril 2015 : Brice FELDEN (Université de Rennes) «Identification de systèmes 'Toxines/AntiToxines' fonctionnels chez S. aureus. Rôles dans la virulence et compétition entre bactéries concurrentes: vers de nouveaux antibiotiques? » invité par : Harald Putzer

27 mars 2015 : Simon LEBARON (Paris Descartes) «Etude de l'integration de la particule 5S aux ribosomes par le complexe d'assemblage Rpf2/Rrs1 chez la levure . » invité par : Ciaràn Condon

13 mars 2015 : Yves BRUN (Indiana University) «Mechanisms and evolution of bacterial morphology. » invité par : Ciaràn Condon

13 février 2015 : Matthieu JULES ( INRA, Jouy en Josas) «From global regulation of bacterial translation to Synthetic Biology. » invité par : Ciaràn Condon

23 janvier 2015 : Rut CARBALLIDO-LOPEZ ( INRA Micalis, Jouy en Josas) «Actin-like MreB dynamics and morphogenetic function in rod-shaped bacteria » invitée par : Ciaràn Condon

16 janvier 2015 : Christophe D'ENFERT ( Institut Pasteur) «Population genomics and control of heterozygosity in the fungal pathogen Candida albicans » invité par : Kyle Tanner

9 janvier 2015 : Isabelle MARTIN-VERSTRAETE ( Institut Pasteur) «Le réseau de régulation contrôlant la sporulation chez Clostridium difficile: un modèle ancestral? » invitée par : Harald Putzer

05 décembre 2014 : Olivier ESPELI (Collège de France) « Genomic regulation of Topoisomerase IV activity during E. coli cell cycle» invité par : Ciaràn Condon

28 novembre 2014 : Alice LEBRETON (IBENS Group Bacterial Infection & RNA Destiny, ENS) «Listeria interferes with gene expression in its host cell » invitée par : Sylvain Durand

21 novembre 2014 : Marie- Eve VAL- KENNEDY (Département Génomes et Génétique, Unité Plasticité des Génomes Bactériens, Institut Pasteur) «New insights into the bi-chromosomal organization of the Vibrio genomes »
invitée par : Ciaràn Condon

07 novembre 2014 : Simonetta GRIBALDO (Institut Pasteur) «Diversity and evolution of the microbial world: the input of phylogenomics » invitée par : Ciaràn Condon

06 novembre 2014 : Ben LUISI (University of Cambridge, UK) «The machinery of bacterial RNA metabolism, from a ribo-centric perspective » invité par : Harald Putzer

17 octobre 2014 : Clément DEGUT (Laboratoire de Cristallographie et RMN biologiques, CNRS UMR8015, Université Paris Descartes, Paris) «Étude structurale et fonctionnelle d'une méthyltransférase catalysant la m1A22 dans les ARNt» invité par : Joël Caillet

26 septembre 2014 : Tarek MSADEK (Institut Pasteur) «Signalisation, survie et pathogenese chez Staphylococcus aureus» invité par : Maude Guillier

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Année 2013 - 2014

 

HDR

Vendredi 16 mai 2014 : Thierry BIZEBARD (Equipe K. Tanner : ARN hélicases) Université Paris 7 D. Diderot

Séminaires

04 juillet 2014 : Udo BLÄSI (University of Vienna) «RNA mediated regulation of sugar metabolism and antibiotic resistance in the human pathogen Pseudomonas aeruginosa.» invité par : Harald Putzer

27 juin 2014 : Martina SCHROEDER (University of Maynooth, Ireland) «The human DEAD-box protein DDX3 in anti-viral innate immune signalling.» invitée par : Kyle Tanner

13 juin 2014 : Jean DEUTSCH (UPMC) «La définition de ce qu'est un gène, et comment cette définition a évolué au cours des dernières décennies
invité par : Marc Dreyfus, Francis-André Wollman

23 mai 2014 : Nicolas JOLY (UMR 7592 CNRS – Université Paris Diderot Paris 7, Institut Jacques Monod, Paris) «Enhancer dependent RNA polymerase activation : new insights on the role of the AAA+ activator.» invité par : Harald Putzer

21 mai 2014 : Knud NIERHAUS (Max-Planck Institüt für Molekular Genetik, Berlin, Allemagne) «Recent Progress in the Understanding of Ribosomal Translocation.» invité par : Thierry Bizebard

4 avril 2014 : Sabine BRANTL ( AG Bakteriengenetik Friedrich-Schiller-Universität Jena D-Jena ) «Bacterial gene regulation by small RNAs: A cis- and a trans-encoded sRNA from the B. subtilis chromosome.» invitée par : Harald Putzer

28 mars 2014 : Carmen BUCHRIESER ( Institut Pasteur) «Legionella sets the host chromatin landscape.» invitée par : Harald Putzer

21 mars 2014 : Marc DREYFUS ( CNRS UMR7141, IBPC) «L'ARN hélicase SrmB, facteur d'assemblage du ribosome bactérien : une histoire en partie à réécrire ?» invité par : Josette Banroques

14 mars 2014 : Etienne MAISONNEUVE ( University of Newcastle) «Molecular mechanisms underlying bacterial persistence in E. coli.» invité par : Ciaràn Condon et Harald Putzer

07 mars 2014 : Gregory BOËL ( Columbia University, NY) «Elucidation of the physiological function and molecular mechanism of a novel ABC-F translation factor that regulates commitment of energetic resources to protein synthesis.» invité par : Josef Deutscher

14 février 2014 : Francis BIVILLE (Institut Pasteur) «Rôle de protéines de la membrane externe liant l'hème chez Bartonella henselae.» invité par : Joël Caillet

7 février 2014 : Théophile OHLMANN (CIRI Lyon, INSERM U 1111, ENS Lyon) «Le rôle de la protéine hélicase DDX3 dans le contrôle traductionnel de HIV.» invité par : Josette Banroques

31 janvier 2014 : Sébastien RIGALI (Centre d'Ingénierie des Protéines, Université de Liège, Belgique) « Streptomyces in Nature and Medicine. » invité par : Jackie Plumbridge

24 janvier 2014 : Philippe BOULOC (Université Paris Sud, Orsay) «A la pêche des cibles et fonctions des ARN régulateurs de Staphylococcus aureus.» invité par : Maude Guillier

17 janvier 2014 : Terence STRICK (Institut Jacques Monod, Paris) «Bottom-up reconstruction of DNA repair pathways, one molecule at a time.» invité par : Marc Dreyfus

29 novembre : Agamemnon. J. CARPOUSSIS (LMGM Toulouse ) « 1) Evolutionary history of the RNA degradosome in the gamma-Proteobacteria and 2) the stabilome of E. coli at different growth rates. » invité par : Ciaràn Condon

22 novembre : Jacques OBERTO (Institut de Génétique et Microbiologie, CNRS UMR 8621, Orsay) «Plasticité du génome chez les Archées Thermococcales : mécanisme évolutif ou maladie génétique ? » invité par : Jackie Plumbridge

15 novembre : Frances FULLER-PACE (School of Medicine, University of Dundee, U.K.) «The multi-functional DEAD box RNA helicase DDX5/p68 : important roles in cancer . » invitée par : Josette Banroques

8 novembre : Benjamin EZRATY (Laboratoire de Chimie Bactérienne, CNRS UMR 7283, Marseille) «Centres Fer-Soufre, stress oxydant et toxicité des antibiotiques : la controverse. » invité par : Ciaràn Condon

11 octobre : Justine COLLIER (Université de Lausanne) « Genetic and epigenetic regulation of the Caulobacter cell cycle. » invitée par : Eliane Hajnsdorf

4 octobre : Sylvie REBUFFAT (Museum national d'Histoire naturelle Laboratoire "Molecules de Communication et Adaptation des Microorganismes UMR 7245 CNRS-MNHN) « Mécanismes adaptatifs et stratégies de défense des bactéries: vers l'ingénierie écologique. » invitée par : Miklos de Zamaroczy

27 septembre : Jeffrey MELLIN (Institut Pasteur) « New mechanisms of RNA-mediated regulation in Listeria monocytogenes. » invité par : Ciaràn Condon

26 septembre : Kevin DEVINE (Smurfit Institute of Genetics, Trinity College, Dublin) « Regulation of cell wall metabolism by the WalRK and PhoPR two-component signal transduction systems in Bacillus subtilis. » invité par : Ciaràn Condon

20 septembre : Claudio GUALERZI (Université de Camerino, Italie) « The quest for new antibiotics : structural and functional characterization of four new translational inhibitors. » invité par : Nara Figueroa-Bossi

13 septembre : Irène AMATA (Université de Barcelone) « Challenges in Structural Bioloy : naked RNAs and intrinsically disordered proteins studied by NMR. » invitée par : Ciaràn Condon et Carine Tisné

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Année 2012 - 2013

 

Thèses

30 septembre 2013 : Meriem SENISSAR (Equipe M. Dreyfus : ARN hélicases) « Recherche des partenaires de l’ARN hélicase à boîte DEAD de levure Ded1. » sous la direction de : Josette Banroques

Séminaires

31 mai 2013 : Susan GOTTESMAN (NIH, Bethesda, Maryland) « Dissecting Hfq function for small RNA-dependent regulation in vivo. » invitée par : Maude Guillier

26 avril 2013 : Béatrice GOLINELLI - PIMPANEAU (Laboratoire de Chimie des Processus Biologiques, Collège de France ) « Ammonia channeling and morpheein allosteric regulation of glucosamine-6-phosphate synthase» invitée par : Harald Putzer

19 avril 2013 : Olga SOUTOURINA (Laboratoire de Pathogénèse des Bactéries Anaérobies, Institut Pasteur ) « Genome-wide identification of regulatory RNAs in the human pathogen Clostridium difficile. » invitée par : Harald Putzer

12 avril 2013 : Béatrice CLOUET D'ORVAL (Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires CNRS-UMR 5100, Université Paul Sabatier, route de Narbonne, Toulouse ) « ß-CASP Ribonucleases in Archaea: Origin and Activities. » invitée par : Josette Banroques

5 avril 2013 : Dror WARCHAWSKI (IBPC, UMR 7099) « La RMN : Comment ca marche? A quoi ça sert?. » invité par : Mathias Springer

29 mars 2013 : Alexandre MAES (Groupe du Dr. Lapouge, Département de Microbiologie Fondamentale, Université de Lausanne, Suisse) « Anatomy of Pseudomonas aeruginosa PAO1 transcriptome. A walk through RNA deep sequencing. » invité par : Eliane Hajnsdorf

22 mars 2013 : Boris GÖRKE (Institute of Microbiology and Genetics Göttingen, Germany) « Control of bacterial cell wall biosynthesis by a hierarchically acting cascade of two small RNAs. » invité par : Marc Dreyfus

15 février 2013 : Christophe GRANGEASSE (CNRS UMR5086, Université Lyon I, IBCP, Bases Mol. & Struct. des Systèmes infectieux) «Rôle de la serine/threonine-kinase StkP dans la morphogenèse du pneumocoque. » invité par : Harald Putzer

8 février 2013 : Djemel HAMDANE (Collège de France, CNRS FRE3488, Lab. Chimie des Processus Biologiques) «When tRNA modification meets flavoenzymology : case of a flavin and folate-dependent tRNA methyltransferase from Bacillus subtilis. » invité par : Harald Putzer

1 février 2013 : Cristel ARCHAMBAUD (Institut Pasteur) « Impact of lactobacilli on orally acquired listeriosis. » invitée par : Ciaràn Condon

25 janvier 2013 : Mart KRUPOVIC (Institut Pasteur) « Archaeal viruses and their interactions with the hosts. » invité par : Ciaràn Condon

18 janvier 2013 : Didier MAZEL (Institut Pasteur) « Integrons, Antibiotics, SOS response and Horizontal gene transfer: intimate connections. » invité par : Ciaràn Condon

11 janvier 2013 à : Anne GALINIER (Laboratoire de Chimie Bactérienne UMR 7283) « YvcK a metabolic sensor involved in morphogenesis in   Bacillus subtilis ?.  » invitée par : Harald Putzer

21 décembre 2012 : Ignacio LUQUE (CSIC : National Research Council of Spain. Instituto de Bioquimica Vegetal y Fotosintesis, Séville, Espagne) «Unique features of aminoacyl-tRNA synthetases in cyanobacteria» invité par : Marc Dreyfus

30 novembre 2012 : Olivera FRANCETIC (Unité de Génétique Moléculaire, Intitut Pasteur) «Pseudopilus assembly and its motor role in type II protein secretion » invitée par : Ciaràn Condon

28 novembre 2012 : Corinne CASSIER-CHAUVAT (Laboratoire de Biologie et Biologie intégrative des cyanobactéries, UMR8221 CEA SACLAY) « Réponses aux stress et reprogrammation métabolique chez les cyanobactéries » invitée par : Marc Dreyfus

23 novembre 2012 : Lionello BOSSI (CGM, Gif-sur-Yvette) « Coupling small RNA function to Rho-dependent transcription termination. » invité par : Maude Guillier

21 novembre 2012 : Micheline FROMONT-RACINE (Institut Pasteur, Unité des Interactions Macromoléculaires, CNRS URA2171) «De nouveaux facteurs impliqués dans la dégradation des peptides aberrants issus de messagers sans stop chez S. cerevisiae. » invitée par : Valérie Heurgué-Hamard

16 novembre 2012 : Efthimia LIOLIOU (IBMC, Strasbourg) «Functions of the endoribonuclease III and of a regulatory RNA in Staphylococcus aureus. » invitée par : Marc Dreyfus

13 novembre 2012 : Edouard BERTRAND (Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier) «The CBCAP complex binds various classes of RNA and links the Cap to 3'end formation and RNA export. » invité par : Stéphanie Kervestin et Philippe Meyer (FRE3354)

26 octobre 2012 : Ivan MATIC (U1001 INSERM, Hôpital Necker) «Induction des réponses au stress et de la mutagénèse par des concentrations subinhibitrices d'antibiotiques. » invité par : Ciaràn Condon

19 octobre 2012 : Diana KIRILOVSKY (CEA, Saclay) «Une protéine photoactive et photoprotection chez les cyanobactéries. » invitée par : Marc Dreyfus

12 octobre 2012 : Cosmin SAVEANU (Génétique des Interactions Moléculaires, Institut Pasteur) «Do ribosomes sense the length of the translated mRNA (in yeast) ?» invité par : Stéphanie Kervestin

05 octobre 2012 : Hannes LINK (Institute of Molecular Systems Biology, ETH, Zurich) «Identification of metabolite-protein interactions that mediate allosteric enzyme regulation in bacterial metabolism.» invité par : Jackie Plumbridge

27 septembre 2012 : Stephen BUSBY (School of Biosciences, University of Birmingham, UK) « Regulation at simple and complex bacterial promoters.» invité par : Mathias Springer

21 septembre 2012 : Yulia REDKO (Institut Pasteur) «The unusual facets of RNA metabolism in the human pathogen Helicobacter pylori.» invitée par : Ciarán Condon

 

 

 

 

 

 

Année 2011 - 2012

 

Thèses

27 septembre 2012 : Audrey COORNAERT (Equipe M. Springer : Contrôle traductionnel chez les bactéries) «Etude de la régulation post-transcriptionnelle de l'expression du système à deux composants PhoQ-PhoP par les ARN régulateurs chez E. coli.» sous la direction de : Maude Guillier et Mathias Springer

4 mai 2012 : Flore SINTUREL (Equipe C. Condon : Maturation et dégradation des ARN chez les microorganismes) «Contrôle de l'activité de l'exoribonucléase 5'-3' Xrn1 par Dcs1 et conséquences physiologiques chez S. cerevisiae.» sous la direction de C. Condon et L. Bénard

Séminaires

4 juillet 2012 : Ghada AJLANI (Institut de Biologie et de Technologies de Saclay, UMR8221 CNRS/CEA/Université Paris-Sud, Gif-sur-Yvette) «Un mécanisme de régulation génétique qui aboutit à la synthèse de deux isoformes de la Ferrédoxine NADP(H) oxydoréductase chez la cyanobactérie Sunechocystis sp PCC6803.» invitée par Marc Dreyfus

22 juin 2012 : Dominique WEIL (Equipe " Compartimentation et trafic intracellulaire des mRNP " CNRS-UPMC FRE 3402, Université Pierre et Marie Curie, Paris) «Evidence for a new model of translational repression and P-body targeting by the Rck/p54 protein.l.» invitée par Josette Banroques

8 juin 2012 : Laurent CHAVATTE (CNRS CGM Gif-sur-Yvette) «Synthesis and regulation of selenoproteins in mammal.» invité par Stéphanie Kervestin

1 juin 2012 : Benoit PALANCADE (Groupe : "Pores nucléaires : transport et cycle cellulaire" Institut Jacques Monod, Paris) «Régulation de l'assemblage des particules d'ARNm (mRNPs) par sumoylation chez la levure.» invité par Josette Banroques

25 mai 2012 : Jean-François ALLEMAND (Laboratoire de Physique Statistique, ENS, Paris) «Réplication de l'ADN en molécule unique.» invité par Marc Dreyfus

30 mars 2012 : Agustino MARTINEZ-ANTONIO (Departamento de Ingenierža Genetica, Centro de Investigacion y de Estudos Avanzados del Instituto Politecnico Nacional, Irapuato, Mexico) «Structural and functional organization of the gene regulatory network in E. coli.» invité par Mathias Springer

23 mars 2012 : Claudine MAYER (Institut Pasteur) «Structural studies of the Mycobacterium tuberculosis DNA gyrase : insights into the quinolone resistance mechanism.» invitée par Marc Dreyfus

9 mars 2012 : Yves BRUN (Clyde Culbertson Professor of Biology, Department of Biology, Indiana University, Bloomington, USA) «Mécanismes et régulation de l'attachement bactérien aux surfaces et de la formation de biofilms.» invité par Mathias Springer

10 février 2012 : Michel WERNER (CEA, Saclay) «Integrative study of the basic mechanisms of genomic transcription and its regulation in vivo: the central role of the Mediator of activation.» invité par Josette Banroques

27 janvier 2012 : Olivier POCH ( Integrative Bioinformatics and Genomics Laboratory, IGBMC, Illkirch) «Evolution in action : towards translational medecin.» invité par Marc Dreyfus

20 janvier 2012 : Domenico LIBRI (CGM, CNRS, Gif-sur-Yvette) «Transcription termination and the control of pervasive transcription in yeast.» invité par Josette Banroques

13 janvier 2012 : Marie BOUVIER (Université Paul Sabatier, Toulouse) «Multiple target regulation by trans-encoded small RNAs in Salmonelle typhymurium.» invitée par Maude Guillier

6 janvier 2012 : François KEPES (Epigenomics Project / Institute of Systems and Synthetic Biology, Genopole, CNRS, Univ. Evry) «Existe-t-il chez les microrganismes un schéma collectif de régulation transcriptionnelle ? » invité par Mathias Springer

9 décembre 2011: Emmanuel MARGEAT (CBS, Montpellier) «Looking at prokaryotic transcription mechanisms using single molecule FRET.» invité par Thierry Bizebard

25 novembre 2011 : Simon LEBARON (Wellcome Trust Center for Cell Biology, University of Edinburgh)«Quelle(s) fonction(s) pour les facteurs de le biogénèse des ribosomes ?»invité par Stéphanie Kervestin

23 novembre : Etienne DERVYN (INRA, Jouy-en-Josas) «Nouvelle carte transcriptionnelle de Bacillus subtilis.» invité par Patrick Stragier

18 novembre 2011 : Jean-Michel JAULT (IBS, Grenoble) «Vers l'identification et la caractérisationd d'une nouvelle famille de protéine-kinases bactériennes.»invité par Harald Putzer

8 novembre 2011 : Fabrice LEJEUNE (Institut Pasteur, Lille) «Nonsense mutation correction using an already known drug on the market.» invité par Stéphanie Kervestin

21 octobre 2011: Ed BRODY (SomaLogic, Inc., Boulder, USA) «Biomarkers and Personalized Medicine : Somamers as Detection Agents.» invité par Mathias Springer

14 octobre 2011: Frédéric BOCARD (CGM Gif-sur-Yvette) «Organisation à grande échelle du chromosome de E. coli : Structuration du macrodomaine Ter par la protéine MatP et ses conséquences.» invité par Marc Dreyfus

12 octobre 2011: Disa HAMMARLÖF (Uppsala, Suède) «Extragenic suppressors of the rne ts phenotype» invité par Maude Guillier

7 octobre 2011 : Olivier CORDIN (WTCB, Swann building, King's building, Universy of Edinburgh) «Brr2, a RNA helicase that regulates other RNA helicases ?» invité par Stéphanie Kervestin et Josette Banroques

5 octobre 2011 : Jean-Baptiste RIOUX (Laboratoire de Bioénergétique Cellulaire, CEA, Cadarache) «Caractérisation d'une nouvelle actine-like chez les bactéries magnétotactiques» invité par Maude Guillier

 

 

 

Année 2010 - 2011

 

Thèses

23 septembre 2011 : Mathieu Chauleau (Equipe M. De Zamaroczy, V. Heurgué-Hamard : Cytotoxines anti-microrganismes, mécanismes de la traduction) "Translocation des colicines de type ribonucléase à travers la membrane interne bactérienne"sous la direction de Dr. Miklos de Zamaroczy

Séminaires

24 juin 2011 : Fabien DARFEUILLE (Université Bordeaux Segalen INSERM U869) «Etude des modules toxine-antitoxine (TA) chez Helicobacter pylori» Invité par Stéphanie Kervestin

17 juin 2011 : Matthieu SAGUY (Equipe Rotavirus, Virologie Moléculaire et Structurale, CNRS UPR3296, UsC INRA; Gif-sur-Yvette) «Etude par Cryo-EM du complexe ribosome-Pseudonoeud d'un frameshift +1» Invité par Valérie Huergué-Hamard et Stéphanie Kervestin

27 mai 2011 : Clémentine DELAN-FORINO (UPMC Paris 6 AnBioPhy-Functions and Interaction of Nucleic Acids) «Le viroïde de l'avocat (ASBVd) : réplication dans un hôte non-spécifique et aspects structuraux» Invitée par Stéphanie Kervestin

29 avril 2011 : Marat YUSUPOV (IGBMC Strabourg) «Crystal structures of bacterial and yeast ribosomes.» Invité par Stéphanie Kervestin

1 avril 2011 : Damien LEDUC (Institut Pasteur) «Trafic et flux d'ammoniac chez Helicobacter pylori.» Invité par Eliane Hajnsdorf

18 mars 2011 : Serge PLAZA (Centre de Biologie du Développement, Toulouse) «Epidermal morphogenesis in drosophila: role of small peptides encoded by putative non coding RNA.» Invité par Maude Guillier

11 mars 2011 : Arnaud GAUTIER (ENS Département de Chimie) «Genetically encoded photocontrol of protein function in living cells.» Invité par Marc Dreyfus et Bruno Miroux

2 mars 2011 : Ulrich BOCKELMANN (ESPCI) «Des pinces optiques aux pinces moléculaires.» Invité par Marc Dreyfus et Mathias Springer

11 févriier 2011 : Jérôme SAULIERE (CNRS UMR8197, Institut de Biologie ENS Paris, Equipe H. Le Hir, section de Génomique Fonctionnelle) «Le dépôt différentiel de l'Exon Junction Complex (EJC) : Impact sur le destin des ARNm.» Invité par Stéphanie Kervestin

28 janvier 2011 : Aurélie GALOPIER (Génétique des Interactions Macromoléculaires, Institut Pasteur, Paris) «TAR1 : un gène hébergé sur le brin antisens de l’ADN ribosomique de Saccharomyces cerevisiae, code une protéine mitochondriale.» Invitée par Stéphanie Kervestin et Valérie Heurgué-Hamard

21 janvier 2011 : Marc GRAILLE (IBBMC, UMR 8619 CNRS-Université Paris-Sud, Orsay) «Contrôle-qualité des ARN induisant des arrêts de la traduction : le  duo  Hbs1-Dom34.» Invité par Stéphanie Kervestin et Valérie Heurgué-Hamard

14 janvier 2011 : Félix WEIS (Structure et Dynamique des Macromolécules, UMR 6026 CNRS-Université de Rennes I) «ARNtm-SmpB, voyage au centre du ribosome bactérien.» Invité par Stéphanie Kervestin

22 décembre 2010 : Fanette FONTAINE (NIH, NICHD, CBMB, Environmental Gene Regulation Lab, USA) «Characterization of small proteins (less than 50 aa) in E. coli.» Invitée par Eliane Hajnsdorf

26 novembre 2010 : Bruno DUPUY (Institut Pasteur) «Regulation des toxines de Clostridium difficile, une régulation pas si simple.» Invité par Mathias Springer

17 novembre 2010 : Josef DEUTSCHER (INRA Paris Grignon) «Fonctions régulatrices du système phosphotransférase dans le métabolisme et la virulence.» Invité par Harald Putzer

5 novembre 2010 : Christophe ZIMMER (Institut Pasteur)«Super-resolution imaging methods for viruses and genes.» Invité par Mathias Springer

25 octobre 2010 : Allen NICHOLSON (Temple University, USA) «Polypeptide determinants of specificity in RNA processing by ribonuclease III» Invité par Marc Dreyfus

18 octobre 2010 : Max GOTTESMAN (Columbia University, USA) «Linking transcription termination, replication and translation in E.coli» Invité par Mathias Springer

8 octobre 2010 : Jacques FRESCO (Princeton University, USA) «Site-specific self-catalyzed depurinatin in genomic DNA, a spontaneous mechanism leading to substitution and short deletion mutations» Invité par Mathias Springer

6 octobre 2010 : Chuck KURLAND (University of Lund, Sweden) «And Size Matters : reductive evolution of proteins is coupled to the coding capacities of genomes» Invité par Richard Buckingham et Mathias Springer

1 octobre 2010 : Daniel VINELLA (LCB, Marseille) «Biogénèse des centres Fe/S : étude in vivo chez Escherichia coli» Invité par Mathias Springer

24 septembre 2010 : Marc BOUDVILLAIN (Centre de Biophysique Moléculaire, Orléans) «Quelques perspectives sur le fonctionnement du facteur de terminaison de la transcription Rho d' Escherichia coli» Invité par Marc Dreyfus

 

Année 2009 - 2010

 

Thèses

30 septembre 2010 : Ailar JAMALLI-ZIAIIFAR (Equipe H. Putzer : Contrôles transcriptionnels et post-transcriptionnels de l'expression génétique) «Étude de la relation structure-fonction des RNases J chez B. subtilis et du chloroplaste de Chlamydomonas rheinhardtii»

27 septembre 2010 : Gwendoline CARTIER (Equipe M. Dreyfus : ARN hélicases)«Métabolisme de l'ARN à froid: comparaison d’Escherichia coli à des bactéries voisines adaptées aux basses température»

17 juin 2010 : Alexandre MAES (Equipe Ph. Régnier, E. Hajnsdorf : Expression génétique et stabilité de l'ARN) «Roles et mécanismes de la polyadénylation dans l'expression génétique chez Escherichia coli»

Séminaires

25 juin 2010 : Agnès FOUET (Institut Pasteur, Paris) «Régulation de l’expression des gènes codant les facteurs de virulence et de persistance de Bacillus anthracis » Invitée par Eliane Hajnsdorf.

11 juin 2010 : Joëlle MARIE (Centre de Génétique Moléculaire, CNRS, Gif-sur-Yvette) « L’ARN hélicase DDX5/p68 : un nouveau rôle dans la Dystrophie Myotonique de type 1 » Invitée par Josette Banroques

28 maI 2010 : Rachid RAHMOUNI (Centre de Biophysique Moléculaire, CNRS, Orléans) «le facteur de terminaison bactérien Rho à la découverte des mécanismes de biogénèse et contrôle qualité des transcrits eucaryotes» Invité par Marc Dreyfus.

21 maI 2010 : Knud NIERHAUS (Max-Planck Institût fûr Molekular Genetik, Berlin, Allemagne) «The 70S scanning mode of translational initiation » Invité par Marc Dreyfus

14 maI 2010 : Aziz EL HAGE (Wellcome Trust Centre for Cell Biology, ICMB, University of Edinburgh) «Topoisomerases I prevents R-loop mediated transcriptional blocks during ribosomal RNA synthesis in Saccharomyces cerevisiae » Invité par Ciaran Condon

7 mai 2010 : Daniel GAUTHERET (IGM, Université Paris-Sud, Orsay «Comment les ARN non-codants sont inventés» Invité par Eliane Hajnsdorf

 

... Il y a eu bien d'autres séminaires avant cette date, mais c'est la date de création de cette version du site.

 

 

 

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