Chimie des Ligands

Une partie de notre activité consiste en le développement et/ou la synthèse de quelques dérivés impliqués dans le mécanisme d'affinité avec certaines protéines. Ces dérivés sont appelés ligands et peuvent agir selon le cas, soit comme inhibiteur de protéine soit comme activateur de protéine. Deux exemples intéressants sont donnés ci-contre concernant la synthèse de la tridécylstigmatelline (voir fig. 1) et du 4-hydroxynonylquinoleyl-N-oxyde (NQNO) (voir fig. 2) qui sont deux inhibiteurs du cytochrome b6f couramment utilisés afin de bloquer la structure du cytochrome avant de procéder à sa cristallisation (voir Stroebel, 2003 and Baymann, 2006 en exemple d'application).

Figure 1: voie de synthèse du TDS d'après Höfle et al. (Höfle, 1984)

Figure 2: voie de synthèse du NQNO d'après Wells (Wells, 1952).

Références

F. Baymann, F. Giusti, D. Picot, and W. Nitschke, The ci/bH moiety in the b6f complex studied by EPR: A pair of strongly interacting hemes, Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 104, 519-524, 2007.

G. Höfle, B. Kunze, C. Zorzin, H. Reichenbach, Antibiotika aus Gleitenden bakterien, XXIII. Stigmatellin A und B-zwei neue Antibiotika aus Stigmatella aurantiaca (Myxobacterales), Liebigs Ann. Chem., 12, 1883-1904, 1984.

D. Stroebel, Y. Choquet, J-L. Popot and Daniel Picot, An atypical haem in the cytochrome b6f complex, Nature, 426, 413-418, 2003.

I. C. Wells, Antibiotic substances produced by Pseudomonas aeruginosa. Syntheses of PYO Ib, PYO Ic, AND PYO III , J. Biol. Chem., 196, 331-340, 1952. Et les références en cela.